Obične i povremene aminokiseline

Obične aminokiseline i sinteza proteina

Aminokiseline koje se najčešće pojavljuju u proteinskim strukturama živih organizama nazivaju se obične ili proteinogene aminokiseline. Iako je u prirodi poznato preko 500 vrsta aminokiselina, postoji samo dvadeset koje nazivamo običnim. Uz njih, postoje i neki rjeđi, nazvani povremeni, koji općenito proizlaze iz metabolizma običnih nakon njihovog uključivanja u proteinski lanac. U kolagenu, na primjer, lizin i prolin, dvije obične aminokiseline, nalaze se u hidroksiliranom obliku (hidroksiprolin i hidroksilzin).

Većina ostalih neobičnih aminokiselina uglavnom spadaju u sastav enzima i hormona proteinske prirode, ili bolje rečeno peptida (ne zaboravite da se za takav protein smatra da se sastoji od više od 100 aminokiselina, a da formiraju oligo i polipeptid 2 do 9 i 10 do 100 su dovoljni).

Među 20 običnih aminokiselina zapamćene su

Alanin, arginin, asparagin, asparaginska kiselina, cistein, glicin, glutaminska kiselina, glutamin, histidin, izoleucin, leucin, lizin, metionin, fenilalanin, prolin, serin, treonin, triptofan, tirozin, valin

Primjeri neobičnih aminokiselina su:

karnitin (uključen u transport dugolančanih masnih kiselina unutar mitohondrija, gdje se koriste za proizvodnju energije);
ornitin, citrulin i homocistein (sudjeluju u metabolizmu aminokiselina - ciklus uree);
hidroksiprolin i hidroksilzin (dio su sastava kolagena i nekih proteina);
sarkozin (ili metilglicin).

Neke aminokiseline također mogu imati komercijalni ili farmakološki značaj.

Natrijev glutamat koristi se u prehrambenoj industriji kao pojačivač okusa (vidi kocku bujona).
L-dihidroksifenilalanin (L-DOPA) je lijek koji se koristi za liječenje Parkinsonove bolesti.
5-hidroksitriptofan (5-HTP) korišten je za liječenje neuroloških simptoma povezanih s fenilketonurijom (nasljednom metaboličkom bolešću koja sprječava uporabu fenilalanina, esencijalne aminokiseline, zbog posebnih enzimskih deficita; nakupljanje fenilalanina u tkivima odgovoran je za teška kožna i neurološka oštećenja).

Biljke i bakterije mogu proizvesti određene aminokiseline koje se mogu pronaći u peptidnim antibioticima, poput nisina i alameticina.

Esencijalne aminokiseline

Neke od 20 običnih aminokiselina nazivaju se esencijalnima, jer ih tijelo ne može sintetizirati iz drugih spojeva, već se moraju uzimati hranom.
Za ljude su to fenilalanin, leucin, izoleucin, lizin, metionin, treonin, triptofan, valin, a u djece histidin i arginin.

Obične aminokiseline, kemijske karakteristike

Na temelju kemijskih karakteristika R radikala (skupina atoma koji tvore ne baš dugačak lanac), aminokiseline se mogu podijeliti u različite kategorije.

Aminokiseline s apolarnim R (ne mogu stvarati vodikove veze):