Peptidna veza je kovalentna veza koja se uspostavlja između dvije molekule, kada karboksilna skupina jedne reagira s amino skupinom druge reakcijom kondenzacije (ili dehidratacijom, što dovodi - odnosno - do uklanjanja molekule vode) .
Obično se peptidna veza stvara između dvije aminokiseline, što rezultira dipeptidom.
Budući da dipeptid u svojoj molekuli još uvijek uključuje amino i karboksi skupinu, može formirati peptidnu vezu s trećom aminokiselinom, čime nastaje tripeptid itd. Kada je broj aminokiselina relativno mali naziva se oligopeptid, a ako se povećava broj aminokiselina naziva se polipeptid ili protein.
U stvarnosti, unatoč slici, peptidna veza nije jednostavnog tipa, već ima 60% jednostruku vezu i 40% dvostruku vezu.
U živim organizmima stvaranje peptidne veze katalizira enzim - peptidil transferaza - prisutan u glavnoj podjedinici ribosoma.
Proteini koji se unose u prehranu također se sastoje od lanaca aminokiselina spojenih peptidnim vezama. Tijekom probave ove se veze razbijaju posebni enzimi (peptidaze) prisutni u želučanom soku i soku gušterače. Pojedinačne aminokiseline, koje crijeva jednom apsorbiraju, izlaze iz krvi i preuzimaju ih stanice - osobito one iz jetre - koje ih spajaju novim peptidnim vezama u tvoreći proteine koji su im potrebni (ne samo strukturni već i hormonski, enzimski itd. U stvari, u prirodi postoji veliki broj proteina, s različitim fizikalno -kemijskim karakteristikama, koji proizlaze iz različitih svojstava 20 običnih aminokiselina i iz njihovog kombiniranja u polipeptidnom lancu. Samo pomislite da protein od 100 aminokiselina, dakle relativno mala, može se sastojati od 20100 = 1,27 x 10130 mogućih polipeptidnih lanaca.Upute za izgradnju ispravnog lanca aminokiselina sadržane su u genomu pojedinca.