Otporni mikrobni sojevi mogu:
- Proizvode enzime koji mijenjaju lijekove (na primjer, beta-laktamaze);
- Promijeniti strukturu na koju lijek djeluje;
- Koristite drugu metaboličku liniju osim one inhibirane;
- Promijenite propusnost stanica, sprječavajući prolaz ili prianjanje molekule djelovanjem antibiotika.
GENE R, koji prenosi rezistenciju na antibiotike, nalazi se u plazmidima, a posebno u TRANSPOSONIMA (stoga se transpozon može naći u plazmidu, ali i integriran u kromosom rezistentne bakterije).
Za daljnje informacije pogledajte namjenski članak: Bakterije: genetika i mehanizmi prijenosa genetskih informacija
organizma, obično sastavljenog od GRAM -a. Također treba imati na umu da sam antibiotik ne stvara rezistenciju (koja proizlazi iz mutacija i prijenosa gena), već je odabire. S druge strane, rezistencija nije fenomen prilagodbe na antibiotik, već događaj - spontan i prenosiv - koji utječe na genetsko naslijeđe bakterije.
Za odabir najprikladnijeg antibiotika u svakoj situaciji potrebno je izolirati bakteriju primjenom odgovarajućih analiza i testova (uzorkovanje brisevima, biopsija itd.). Bakterije se zatim natjeraju da se umnože u prikladnim medijima za kulturu; tada se različiti antibiotici testiraju metodom koja se naziva antibiogram.
Bakterije se zatim šire (tehnički naziv platirano ili inokulirano) u petrijevu zdjelu koja sadrži agarni medij (kruta tvar), unutar kojeg se distribuiraju upijajući papirnati diskovi (zvani bibula). Svaki od ovih diskova natopljen je određenim antibiotikom. Nakon 24 sata procjenjuje se rast bakterija oko diska: što je veći radijus inhibicije, to će antibiotik biti učinkovitiji.
Postoje dvije vrste antibiograma, jedan izravni i jedan neizravni. Prvi se izvodi izravno na patološkom materijalu i ima veliki nedostatak što nije selektivan (znamo da je određeni antibiotik bio manje -više učinkovit od drugog u smanjenju mikrobne populacije, ali ne znamo koliko je aktivan protiv pojedinačni patogen). S druge strane, u neizravnoj se patološki uzročnik najprije izolira iz uzorka, a različita ispitivanja provode se samo na njemu.
Za zaustavljanje fenomena rezistencije na antibiotike važna je i suradnja pacijenta koji mora nastaviti terapiju do vremena koje odredi liječnik bez prekida - kako se to često događa - na prve znakove poboljšanja.