Postoje posebni metabolički putevi koji se mogu definirati kako bi se identificirala izgradnja specifičnih molekula.
Put skimimske kiseline: sekundarni metabolički put koji ima prekursor scimimsku kiselinu, molekula koja u sebi sadrži one strukturne i kemijske karakteristike koje se mogu pronaći u sekundarnim metabolitima koji iz nje potječu.
Molekula scimimske kiseline sastoji se od: 6-članog prstena, 1 karboksilne skupine i 3 hidroksilne skupine. Istu tu molekularnu arhitekturu možemo pronaći u sekundarnim metabolitima koji iz nje potječu, a koji se zapravo nazivaju derivatima kiselina. scichimic. Scichimic acid potječe od spajanja dva međuprodukta dva različita primarna metabolička puta:
eritrozij-4-fosfat (3C): međuprodukt tamne faze fotosinteze, anabolički metabolički proces;
fosfoenolpiruvična kiselina (3C): međuprodukt glikolize, katabolički metabolički proces;
Stoga je eritrozij-4-fosfat + fosfoenolpiruvična kiselina = scimiminska kiselina: prvi prekursor sekundarnih metaboličkih puteva.
Stanica sintetizira scimimsku kiselinu kada su potrebe takve da to dopuštaju ili kada su količine dva primarna međuprodukta tolike i takve da se mogu akumulirati; to se događa kada u stanici postoji dovoljna količina ATP -a, a to usporava reakcije primarnog katabolizma i anabolizma.
Put malonske i mevalonske kiseline: oba prekursora potječu od molekule acetil -CoA, pa su oba u osnovi jednog puta: acetatnog puta. Acetil -CoA je molekula povezivanja između glikolize i Krebsovog ciklusa pa ga stoga možemo definirati kao međuprodukt primarni metabolizam stanice.
Acetatna skupina (skupina s dva atoma ugljika) + CoA (koenzim A) = Acetil CoA: molekula koja pripada primarnom metabolizmu, a koja se koristi kao biološki gradivni blok u izgradnji sekundarnih metabolita.
Acetatni put tada se razlikuje po putu malonske kiseline i putu mevalonske kiseline.Koenzim A djeluje kao transport dviju ugljikovodičnih jedinica iz citoplazme u mitohondrije stanice, gdje se odvija Krebsov ciklus. Umjesto toga ugljik se transportira na drugo mjesto u slučaju viška energije i mogu činiti najrazličitije sekundarne metabolite; oni imaju paran broj ugljikovih atoma kao zajedničku karakteristiku, uključujući malonsku kiselinu (C4) i mevalonsku (C6).
Metabolički putevi scimimske kiseline i acetata stoga posjeduju preciznu molekularnu arhitekturu, što nam omogućuje da lako identificiramo njihove sekundarne derivate. Za the alkaloidi, koje imaju raznoliku arhitekturu, identifikacija prethodnika nije tako laka; drugim riječima, nije tako lako klasificirati pojedine kategorije alkaloida, prateći svaki od njih do jednog prethodnika. Alkaloidi, u stvari, imaju više od jednog prekursor, budući da potječu od aminokiselina (primarni spojevi dušika, koje stanica koristi za proizvodnju sekundarnih dušikovih molekula). Sekundarni metaboliti dušika uglavnom su alkaloidi, ali postoje i druge molekule s nižim zdravstvenim profilom od njihovih, poput cijanogenih glikozidi (sadržani u gorkim bademima) i β-cijanovi (pigmenti) Aminokiseline su dušikovi spojevi međusobno raznoliki i ta raznolikost odražava raznolikost njihovih izravnih derivata, a to su alkaloidi.
Jedini kemijski element koji ujedinjuje različite kategorije alkaloida je atom dušika zatvoren u heterociklički prsten ili barem atom dušika sa slobodnim elektronskim dubletom koji im daje osnovna svojstva; ista osnovna reaktivnost koja nam omogućuje izdvajanje pojedinih alkaloida pomakom.
Možemo to sažeti rekavši to put ugljikohidrata je metabolički put koji je u osnovi sinteze svih sekundarnih metabolita, stoga uključuje sve prethodno viđene metaboličke putove:
- acetat je proizvod potpunog rušenja molekule glukoze;
- aminokiseline proizlaze iz metaboličkih procesa razgradnje ugljikohidrata;
- scimimska kiselina je prekursor sekundarnih metabolita, ali i aromatskih aminokiselina (fenilalanin, triptofan i tirozin);
-glikozid je sekundarni metabolit koji se sastoji od šećera i jedinice koja nije šećer, naziva se aglikon, a koji vjerojatno potječe od jednog od sažetih metaboličkih puteva.
Svi biogenetski gradivni elementi iz kojih potječu sekundarni metaboliti potječu ili iz katabolizma ugljikohidrata ili iz njihovog anabolizma. Ti su šećeri iste šećerne jedinice koje su nekad povezane s aglikonom činile glikozide.
Metabolički put acetata podijeljen je u gusto biogenetsko stablo koje sadrži sve nazive sekundarnih metabolita do kojih dolazi. Različiti, ovisno o potrebama same stanice:
- Krebsov ciklus s konačnom proizvodnjom ATP -a (primarni metabolizam);
- β-oksidacija i sinteza masnih kiselina (primarni metabolizam);
- Sinteza malonata ili malonske kiseline (4C), koja proizlazi iz sjedinjenja dviju molekula acetata, i mevalonata ili mevalonske kiseline (6C) koja nastaje sjedinjenjem tri molekule acetata. Stanica koristi te dvije molekule s parnim brojem ugljikovih atoma za izgradnju različitih molekularnih kategorija, koje se sastoje od linearnih lanaca ugljikovodičnih jedinica, poput: masnih kiselina - koje se koriste za proizvodnju glicerida i voskova - terpenoida, antrakinona i steroida.
Ostali članci o "Biogenezi i karakteristikama aktivnih sastojaka"
- Primarni metabolizam i sekundarni metabolizam biljke
- Farmakognozija
- Metabolički put scimimske kiseline