Normalna funkcija kalprotektina je, dakle, suzbijanje razvoja bakterija i gljivica u tijelu (antimikrobno djelovanje).
U prisutnosti "upale u gastrointestinalnom traktu, bijela krvna zrnca migriraju do njega i oslobađaju protein čija se koncentracija u stolici u skladu s tim povećava.
Iz tog razloga, kalprotektin se može koristiti kao pokazatelj upale u slučajevima kroničnih crijevnih bolesti, nekih infekcija bakterijskog podrijetla ili karcinoma probavnog sustava.
Fekalna doza kalprotektina jedini je test koji može pružiti informacije o mjestu upale. Određivanje parametra u plazmi, s druge strane, naglašava upalno stanje koje se može lokalizirati bilo gdje. Nadalje, u bolesnika s kroničnim upalnim bolestima crijeva (poput ulceroznog kolitisa i Crohnove bolesti), doziranje fekalnog kalprotektina valjan je pokazatelj stupnja upale.
; prisutna u svim dijelovima ljudskog tijela, koncentrirana je uglavnom u citoplazmi neutrofilnih granulocita.U nižim koncentracijama kalprotektin je također prisutan u monocitima i u makrofagima koji iz njih potječu; te su stanice, slično neutrofilima, bijele krvne stanice namijenjene fagocitizaciji - dakle zahvatanju, probavi i uništavanju - stranih čestica koje su prodrle u organizam, uključujući mikroorganizme (prema kojima su neutrofili aktivniji).
I neutrofili i makrofagi imaju sposobnost izlučivanja kemijskih posrednika upalnog odgovora.
Unutar ovih imunoloških stanica, kalprotektin pokazuje visoku bakteriostatsku i mikostatsku aktivnost; kao takav, učinkovito se suzbija rast gljivica i bakterija.